Căn chỉnh cấu trúc (genomics)

Căn chỉnh cấu trúc là một hình thức căn chỉnh trình tự dựa trên so sánh hình dạng.

Những sắp xếp này cố gắng thiết lập sự tương đương giữa hai hoặc nhiều cấu trúc polymer dựa trên hình dạng và cấu trúc ba chiều của chúng.

Quá trình này thường được áp dụng cho các cấu trúc cấp ba protein nhưng cũng có thể được sử dụng cho các phân tử RNA lớn.

Trái ngược với sự chồng chất cấu trúc đơn giản, trong đó ít nhất một số dư lượng tương đương của hai cấu trúc được biết đến, sự liên kết cấu trúc không đòi hỏi kiến ​​thức chuyên môn về các vị trí tương đương.

Căn chỉnh cấu trúc là một công cụ có giá trị để so sánh các protein có độ tương tự trình tự thấp, trong đó mối quan hệ tiến hóa giữa các protein có thể dễ dàng được phát hiện bằng các kỹ thuật căn chỉnh trình tự tiêu chuẩn.

Do đó, sự liên kết cấu trúc có thể được sử dụng để ngụ ý mối quan hệ tiến hóa giữa các protein có chung rất ít trình tự phổ biến.

Lưu ý:   Văn bản trên được trích từ bài viết trên Wikipedia “Căn chỉnh cấu trúc (genomics) “, đã được phát hành theo Giấy phép Tài liệu Tự do GNU .
Th6 29, 2020

Những bài viết liên quan